Le NCIS mène des investigations sur un lien potentiel entre le cartel Nexus et Carla Marino, une mafieuse. L'équipe met au jour un complot de grande ampleur au cours duquel du matériel nucléaire a été volé. Parker va se voir contraint de conclure une alliance à risque qui pourrait déterminer le sort de l'opération ainsi que son propre avenir.